Печери — складний (розгалужений або, навіть лабіринтовий) двоярусний комплекс підземних галерей — житлових та поховальних приміщень. Відкриті наприкінці 19 ст., Кирилівські печери досліджувалися у 1949—52 рр І. Самойловським. Результати досліджень свідчать, що печери виникли раніше, ніж церква, збудована в 12 ст. Є підстави вважати, що печерний комплекс сформувався в 11—12 ст. як початкове печерне поселення ченців Кирилівського монастиря.
Нині частину підземних споруд забудовано камінням, інша перебуває в аварійному стані, загрожуючи цілісності наземних споруд. Пам'ятка потребує термінового ретельного вивчення й консервації.
Матеріали досліджень зберігаються в Інституті археології НАН України [628].